Кукушкин лен является раздельнополым растением Оплодотворение связано с водой, с током воды сперматозойды с мужской особи находят яйцеклетки, которые располагаются на женском гаметофите. происходит оплодотворение. На женском гаметофите вырастает спорофит (коробочка с крышечкой). Споры созревают, коробочка открывается и споры высыпаются. Из споры вырастает протонема, а из протонемы вырастает взрослый гаметофит.